后来异常现象在木叶村迅速扩散，六代火影下达了紧急疏散命令，并决定将村子整体迁移，木叶原本的地址会被永久封锁。
可就在忍者即将撤离之时，木叶村的时空忽然发生了错乱，村子仿佛变成了一个时间线交织重合的迷宫，离开的难度直线飙升。
同时世界各地的游客突然纷至沓来，他们的时空好像也混乱了，前一秒还在水之国的街道上行走，下一秒可能就会走到木叶的大门口。
村子的街道上还出现了不少假的告示牌，诱导那些误入木叶村的人逐渐迷失，没办法，木叶高层只能拟定各种规则条例，对抗那种未知的侵蚀。
一开始的时候，所有人都以为只有被污染的人才能看见那些不属于现实世界的景象，对历史的记忆和认知也会遭到扭曲，只要身体还没产生变异就还有救……
“可后来我们才发现，它是混沌的、不可名状的、无法理解的存在，无人能窥视它的全貌，人类对它的认知永远都是片面的、充满随机性的……”
“说人话！”
“呃……，简单来说就是，出现在木叶村的那些规则告示，每一块都可能是真的、也有可能是假的，包括木叶高层制定的对抗守则也遭到了这种不确定性的干涉。同一条逃生路线，有些人走到终点见到的是安全出口、而有些人则会被彻底污染……”鸣人侃侃而谈的说道。
出现在木叶村的规则就像是在恶搞，可任何规则都不遵守的人，绝对没有好下场。与其说那些规则像是薛定谔的猫，还不如说它们像是性格多变的小朋友，当然，这只是鸣人对它的片面理解，没人知道它究竟是什么。
“那你又是怎么来到这里的？”
“我在村子里迷路了，走着走着就看见了木叶的大门，一脚迈出去后，回头一看，木叶已经变成了废墟。”谈及木叶的覆灭时，鸣人的情绪没有丝毫波动，他对木叶本就没剩多少感情，况且毁掉的又不是他熟悉的那个木叶。
“后来我才意识到，这里可能是另一个世界，再后来我就遇到了你。”
“那你的运气还真是好啊，吊车尾的。”黑发少年一脸傲娇的扬着下巴，表情还像从前一样不可一世，可惜再怎么故作姿态，他的身高也只到鸣人的胸口而已。
“佐助，咱们两个好不容易才重逢，你怎么可以对我这么冷淡！”鸣人状似委屈的说道。
“事实上，在我的认知中，我和你分开的时间还不到三个小时。”佐助的神情看起来很淡定，他没有说谎，他记得自己刚和鸣人在终结谷打了一架，然后就被那个疯子抓住了，再然后他就晕了过去。
醒来时佐助发现自己躺在终结谷，没被木叶忍者抓回村子，这令他感到很疑惑，不久之后，一个长大的鸣人就从村子的方向走了过来。
经过一系列“友好”协商过后，鸣人和佐助互相确认了身份，又互相核对了一下各自的情报。
他们现在不得不接受“穿越”这个事实，然而由于某种未知原因，时间出现了差异，鸣人已经长大成人，可佐助还是个半大少年，但这并不影响他们之间的情谊。
他们很快就展开了对新世界的探索，并从几位幸存的木叶忍者口中获得了许多有用的信息。
这个世界没有漩涡鸣人和宇智波佐助。
四代火影波风水门的孩子出生后没多久就夭折了，因为他只是个婴儿，无法承受九尾的闹腾，所以他死了。
对此，没有任何人感到意外，把九尾封印在一个刚出生的小孩子身上，本就是一件极为冒险的事情，就算他拥有漩涡一族的血脉，难道他刚出生时的体质就会比成年人更健壮？
宇智波的灭族之夜依旧上演了，唯一不同的是，这个世界的宇智波佐助挺聪明的，他很快就察觉到了灭族事件中的种种诡异之处，甚至对村子产生了怀疑。
可惜那时他的年龄太小，没能掩饰好自己的情绪，于是他没过多久就被|自|杀了。
一个失去了鸣人和佐助的木叶，仿佛并没有产生太大的变化，这个村子从不介意损失一两个天才，有时候天才都会被当成炮灰使用。
所有人都以为，在三代火影等高层的领导下，木叶仍然能维持较长时间的稳定，可没想到灾难猝不及防的就降临了。
大蛇丸发起的木叶崩溃计划戳破了木叶的虚假繁荣，纲手成为了五代目火影之后，才发现木叶的新生代忍者出现了跳崖式断层。
当年木叶有白牙、有三忍、有金色闪光、有宇智波一族和日向一族的诸多强者，可现在的木叶……
日向宁次是少见的天才，然而他心怀怨恨，村子只能放弃他；春野樱失去了第七班的光环，纲手根本注意不到她，也没机会收她为弟子，春野樱只能泯然众人；我爱罗依旧是个暴戾青年，四代风影去世之后，我爱罗的日子愈发不好过了。
宇智波鼬因为佐助之死，没少和木叶高层撕逼，但最终他还是选择在暗中守护木叶，直至病死。
可惜他病死之后，晓组织就开始抓捕尾兽了，木叶虽然掩盖了失去九尾的消息，但却没能瞒过晓组织的情报官白绝，木叶因此没有遭到晓组织的侵袭。
秽土转生的金角银角可以替代九尾查克拉，长门终于合成了十尾，命运于此刻发生了一点偏移，宇智波鼬和木叶高层撕逼时，团藏曾施展过一次伊邪纳岐，长门和小南提前得知了伊邪纳岐的情报，带土没能夺走轮回眼，却被长门和小南联手反杀了。
黑绝很快也遭到了长门的封印，智慧不高的白绝迅速倒向了长门，他们本就是神树的副产物，听从神树主人的指挥才是正理。
长门实现了自己的梦想，以一己之力震慑了全世界，木叶本来是想召开五影大会共同对抗晓组织，可惜长门没给他们机会，木叶被他当成了杀鸡儆猴的鸡，五分钟之内就被夷为平地。
胜利者即是正义，哪怕晓曾经是恐怖组织，但在长门拥有了绝对实力之后，所有人都不得不承认晓组织取代了曾经的木叶，成为了凌驾于其他忍村之上的存在。
火之国失去了忍村的保护，但由于长门的威慑，没人敢发动侵略战争。或许长门并不懂得如何治理国家、如何维护社会稳定、如何促进文明发展，可无敌的力量让他拥有了极高的容错率，他可以去慢慢尝试。
况且只要长门的力量一直这么强大，总会有聪明人愿意成为他的智囊。
“我觉得这个世界挺不错的。”佐助率先表达了自己的看法。
鸣人认同的点了点头：“只要长门初心不变，世界就不会爆发大规模战争，除非有更强大的力量推翻了长门，但短期内显然是不可能的。”
未来可能会出现大筒木桃式等强敌，可长门也会成长，届时谁输谁赢还是个未知数。
失去了鸣人和佐助，对木叶来说是致命的，但对于整个世界来说，却只是一件微不足道的小事，长门可以顶替他们的位置、宇智波斑和千手柱间也可以从净土归来顶替他们的位置、甚至六道仙人可以亲自出手……
从异世界穿越而来的鸣人和佐助，不再是木叶的人柱力、也不再是执着于复仇的宇智波末裔，他们摆脱了缠绕在身上的沉重枷锁，唯一的遗憾就是他们两人不可避免的产生了代沟。
鸣人自觉承担起了父亲和哥哥的身份，这令佐助有点小小的不爽，不过他很快就适应了，从未怀疑过为什么当年的单蠢吊车尾会发生如此巨大的变化。
幸存的木叶忍者中，还有一小部分人总想着重建木叶，他们不认识鸣人，但却认识佐助，宇智波佐助的名字、相貌、写轮眼，都可以让人确认他的真实身份。
佐助遭到了道德绑架，这很符合木叶的作风，可惜此佐助非彼佐助，怎么可能会答应那种无理要求？
然而木叶在某一天还是死灰复燃了，原本的废墟上重新出现了一个“木叶村”，那些幸存者们兴高采烈的回归了村子，却看见村子的大门口矗立着一块告示牌，上面写着很多奇奇怪怪的“游客守则”。
进入“木叶”的人再也没有出来过。
鸣人听到这个消息的时候大吃一惊：“那种污染已经可以跨世界扩散了？”
还是说某些人将污染带来了这个世界？
长门最后封锁了木叶，但仍然挡不住“游客”的到来，后来他只好废物利用，把木叶当成了流放之地，那些不好处理的棘手敌人，也算是有个好去处了。
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