黑衣组织陷入了一场巨大的混乱之中。
以琴酒为首的一派主张救回乌丸莲耶,而以朗姆为首的一派则是支持朗姆上位，成为新任首领。当然，其中有多少水分那就不必说了,卧底们当然是能把水搅多浑就把水搅多浑,真正的组织成员忠诚于某个人的是少之又少，除了有利益牵扯的，大多数人都选择明哲保身默默观望。
不管是琴酒还是朗姆,在组织里都是积威甚重,划水摸鱼只想拿钱的成员们当然是哪边都不想得罪。毕竟这两个人无论得罪谁，之后的报复都一定极难消受。
代号波本的降谷零原本是偏向朗姆这一派的,以前在面对琴酒的为难时还借过朗姆的势,现在正是争夺组织大权的关键时刻,朗姆当然不会把这把好用的刀落下。
但是公安卧底降谷零不想帮朗姆，他只想隔岸观火。
上次抓捕乌丸莲耶那天,那么多御主看到了他的脸，自然知道他不是真正的组织的人，更何况他后来还联系了公安那边给这些孩子安排拆弹手术，他的真正背景是什么已经一目了然了。
被这么多人知道自己的真实身份,哪怕他们并不是组织的人,也自发主动地说不会将他的身份说出去，但组织的手段那么多，谁又能真正保证得了呢？他这个卧底的身份,已经算是暴露一半了。
比起留在组织，他更愿意自己把自己的行踪隐藏起来，毕竟在从顾问手里拿到组织大量的情报之后,这个身份的作用已经不大了。
不过顾问的真实身份倒是让他大吃了一惊,当时离开的时候他还以为顾问在乌丸莲耶被袭击的时候跑了呢,没想到是小泉红子给他打了掩护。
浏览过顾问打包发送给他的组织情报，降谷零心情非常好地开始安排国内一系列针对黑衣组织势力的打击计划。
接收到朗姆的邮件让他去对琴酒那方的人下手时，降谷零脑子一转，欣然接下了任务。
即使是组织的情报员，他对组织内部的成员也不是全然知晓的。朗姆让他去杀的人，只会是站在琴酒那边的，他动手刚好能剪除一部分黑衣组织的势力，唯一需要他掌握的，就是琴酒一方与朗姆一方的平衡。
在借着朗姆这股东风剪除了一部分琴酒一侧的组织成员后，降谷零收到了新的来自朗姆的邮件——
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那些逃跑的御主，务必在他们拆弹之前全部抓回来！
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迅速浏览完这封短短的邮件，降谷零当即就冷笑了一声。
终于来了。
这么多天了才给他下达这样的任务，看来朗姆也不像他表现的那么信任自己，非得等到其他人找不到了才把他列入这个任务的执行人名单。不过很可惜，他信错了人。他的那些手下之所以一直找不到人，正是因为他让公安那边的人帮忙遮掩了这些御主的行踪。
而且就连心脏上的炸弹也拔除了。
拥有从者的御主对组织来说是无可取代的一把利剑，组织里无论是那一边都不会轻易放过，只不过先动手的朗姆上位取代乌丸莲耶掌控黑衣组织这个庞然大物的野心暴露得有些明显罢了。
正是因为预料到由于乌丸莲耶被捕而引起的组织内部的对立，自以为执棋的人会将组织内部的局势搅乱，为了掌握主动权而搜寻这些御主的下落。降谷零特意跟这些孩子沟通还做了一番思想工作，让他们同意暂时留在由公安为他们准备的安置之处，配合公安隐藏自己的行踪，等待这个风头过去。
即使他们的从者已经因为迦勒底做的思想工作而遣返回了英灵座，但他们拥有召唤从者的才能这点是不会变的，对组织而言，作为工具（从者）的使用媒介的御主们才是真正珍贵的。因此，他们的处境就目前而言还并不算安全。
将所有利害关系跟这些御主们摆明之后，他们也很理解地暂时没有与家人联系。在了解了黑衣组织有多么大的能量后，能够走到这一步并不傻的御主们很明白这个时候与外界联系有多么容易被组织发现，如果他们贸然与家人联系，很有可能会把危险带给自己的亲人。
既然你下达了这样的任务，那我就可以光明正大地摆烂了）
降谷零压根没把朗姆的任务当回事，就做了个样子，毕竟作为一瓶假酒他也不可能傻到自己暴露自己。
而与他同居中的白羽未来，在抓到乌丸莲耶那天后就没再回过他们同住的公寓，一开始他还以为对方是因为乌丸莲耶被捕心里害怕才跑路换了住处，直到他从柯南口中得知对方早已恢复过所罗门的身份，并且还当着琴酒的面违背了他的命令，自己使用了圣杯。
这跟当着琴酒的面宣布背叛也没啥区别了，那么他之前的猜想自然就不成立。那对方离开的原因，难道是怕连累他暴露身份，所以才不回来的吗？
从阿笠博士家交流完情报回到住处的降谷零看着空无一人的屋子，神色愈发沉凝起来。他恍然记起，所罗门是拥有能够看透过去、现在、未来的冠位级千里眼的人，会选择这个时候离开，难道是他之后被组织发现是卧底了？甚至是被组织的人杀了？会是谁？琴酒？还是朗姆派来的人？
拥有千里眼的人做出的任何反常行为，降谷零一点都不敢小视，像卧底这种行走在钢丝上稍不留神就会粉身碎骨的职业，露出丝毫破绽，就有可能全盘皆输！
然而事实并非是像降谷零猜测的那么复杂，他只是被顾问送到了阿笠博士家暂住而已。
帮忙隐瞒的柯南一开始并不是自愿的，毕竟那可不只是黑衣组织的顾问，还是那个传说中的“犯罪界的拿破仑”莫里亚蒂教授啊！！！
三个惊叹号甚至都不足以表达出他受到的全部惊吓。
直到顾问先生脱了外面那层假皮——
他的偶像——福尔摩斯的脸，在顾问的脸上长了出来！
幸好是灵子光晕滤化版，不然得有多掉san啊？将来只要回忆起莫里亚蒂的身体上长出了福尔摩斯的脸，他一定能半夜吓醒！
不过也幸好这个黑衣组织的顾问是福尔摩斯先生，不然要是换成莫里亚蒂本人，他怀疑现在他们这些红方战线的人恐怕都已经被一网打尽了！毫不夸张的说，他一点都不怀疑莫里亚蒂的能力，毕竟恶人不像好人，有那么多顾忌，他完全能浪费式地消耗组织的力量来铲除内里的威胁。
福尔摩斯把罗曼送到阿笠博士家的原因其实也与组织无关，从者们回迦勒底的回迦勒底，回英灵座的回英灵座，灵子转移来到这个世界的藤丸立香和玛修能回迦勒底，但以人类身份存在于这个世界的罗曼不行。如果他想回迦勒底，只能从这边进行灵子转移，而这个办法目前面临的最大困境，是没有灵子框体。
罗曼作为迦勒底多项研究项目的负责人和参与者，迦勒底很多高科技以及科学与魔术结合的研究，他都能复刻，灵子框体也是他能复刻的物品之一。而身为一个发明家的阿笠博士，他那拥有不小的用于实验的空间的家，就成了一个用来制造和存放灵子框体的上佳选项。
为了征得阿笠博士的同意，迦勒底甚至同意了灵子框体技术的技术共享。
虽然同住在阿笠博士家的灰原哀提出了异议，但在福尔摩斯将从黑衣组织拷贝出来的aptx4869的相关研究资料拿出来后，灰原哀立刻就心动了。作为a药曾经的主要研究人员，她有自信能在拿到资料后以最快的速度将a药的解药研制出来。
两个科研人才沦陷之后，罗曼暂时留在阿笠博士家的事情就成了定局。至于柯南？他早在见到福尔摩斯的那一刻就已经沦陷地差不多了。
在降谷零带着公安打配合，与其他来自各国的卧底不约而同地抓住机会，如火如荼地痛击组织全球各地的势力时，仿佛人间蒸发了一般的罗曼其实并没有很努力地在复刻灵子框体。
自从上次降谷零来阿笠博士家见过柯南以后，和完全不适应见到波本——用她的话来说是对黑衣组织的成员有应激反应——的灰原哀躲在地下室偷听的罗曼，突然就想起了一件最近因为意外太多而被他忘在脑后的事——他的漫画已经断更半个月啦！
在成为所罗门时他的手机就落在了a－6实验基地，许愿成为人类后自然也没有自己的手机。而之后他一直住在阿笠博士家，在外界也没有什么必须要联系的人，要联系出门的博士或者灰原甚至是柯南时，他使用博士家的座机就行了。而除此之外的其他想要联系的人……电话其实也联系不上。这就导致了，催更的石井编辑发了无数封邮件要稿子，愣是一封都没传到罗曼手上。
非常具有责任感的罗曼想起那断更了半个月的漫画，只能拜托阿笠博士帮他买一套作画工具，放下手头的研究制造工作，原地赶稿。
时常跑来看灰原哀的a药解药研究进度的柯南看到他在画漫画时，被迫害的琴酒、降谷零、赤井秀一甚至是现在的自己……同时涌进了他的脑海之中。他不禁面色复杂起来，向这个几乎是当着琴酒的面宣布背叛的家伙轻声问道——
“罗曼先生，你准备给琴……银子小姐，画个什么结局？”
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